حساسیت ژنوتیپی و ضد میکروبی Acinetobacter baumannii مقاوم به کارباپنم
چکیده
اسینتوباکتر بومانی مقاوم به کارباپنم (CR-AB) باعث عفونت های بیمارستانی جدی، به ویژه در بخش های ICU بیمارستان ها، در سراسر جهان می شود. بیان ژن های bla OXA مکانیسم اصلی ایجاد مقاومت کارباپنم در بین CR-AB است. اگرچه برخی از ژنهای bla OXA در بین جدایههای CR-AB از ایران مورد مطالعه قرار گرفتهاند، اما ژنهای شبه bla OXA-23 آنها بررسی نشده است. ما از یک Multiplex-PCR برای شناسایی کارباپنمازهای کلاس A، B و D Ambler در 85 ایزوله استفاده کردیم و مشخص کردیم که 34 ژن شبه bla OXA-23 را در خود جای دادهاند. ژنوتیپسازی چندشکلی طول قطعه (AFLP)، و به دنبال آن توالییابی DNA آمپلیکونهای شبه bla OXA-23 CR-AB از هر گروه AFLP برای توصیف ژنهای شبه bla OXA-23 آنها استفاده شد. ما همچنین الگوی حساسیت ضد میکروبی جدایههای CR-AB را ارزیابی کردیم و آزمایش کردیم که آیا توالیهای ISAba1 و ISAba4 درج شدهاند یا خیر. مقایسه توالی با سویه مرجع A. baumannii (NCTC12156) پنج نوع جهش را در ژنهای شبه bla OXA-23 نشان داد. از جمله یک نوع جدید و چهار جهش یافته که قبلاً از چین و ایالات متحده گزارش شده بود. همه جهشهای ژنهای شبه bla OXA-23 با افزایش حداقل غلظت مهاری (MIC) در برابر ایمی پنم همراه بودند. توالی های ISAba1 و ISAba4 در بالادست ژن bla OXA-23 به ترتیب در 19 و 7 درصد از جدایه ها شناسایی شدند. جداسازی CR-AB با جهش های جدید bla OXA-23 از جمله برخی از جهش های گزارش شده از ایالات متحده و چین، توزیع فراگیر CR-AB را برجسته می کند، که بر اهمیت تلاش های هماهنگ ملی و جهانی برای کنترل گسترش ایزوله های CR-AB در سراسر جهان تاکید می کند.
Abstract
Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii (CR-AB) causes serious nosocomial infections, especially in ICU wards of hospitals, worldwide. Expression of bla OXA genes is the chief mechanism of conferring carbapenem resistance among CR-AB. Although some bla OXA genes have been studied among CR-AB isolates from Iran, their bla OXA-23-like genes have not been investigated. We used a multiplex-PCR to detect Ambler class A, B, and D carbapenemases of 85 isolates, and determined that 34 harbored bla OXA-23-like genes. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) genotyping, followed by DNA sequencing of bla OXA-23-like amplicons of CR-AB from each AFLP group was used to characterize their bla OXA-23-like genes. We also assessed the antimicrobial susceptibility pattern of CR-AB isolates, and tested whether they harbored insertion sequences ISAba1 and ISAba4. Sequence comparison with reference strain A. baumannii (NCTC12156) revealed five types of mutations in bla OXA-23-like genes; including one novel variant and four mutants that were already reported from China and the USA. All of the bla OXA-23-like genes mutations were associated with increased minimum inhibitory concentrations (MICs) against imipenem. ISAba1 and ISAba4 sequences were detected upstream of bla OXA-23 genes in 19 and 7% of isolates, respectively. The isolation of CR-AB with new bla OXA-23 mutations including some that have been reported from the USA and China highlights CR-AB pervasive distribution, which underscores the importance of concerted national and global efforts to control the spread of CR-AB isolates worldwide.
click to read more.
